入侵物种、病原体和寄生虫可能对水生生态系统造成显著生态影响,并对人类健康与经济带来风险。相关机构认为,尽早发现此类生物威胁是降低影响的重要环节。蒙特雷湾水族研究所(MBARI)近日介绍,一款面向水生环境监测的低成本自主机器人DNA采样器已完成开发,旨在为资源管理者、决策者及社区提供更便捷的监测工具。
这款设备名为FIDO(Filtering Instrument for DNA Observation,DNA观察过滤仪),可在湖泊、河流与溪流等环境中自动采集环境DNA(eDNA)样本,用于检测水体中的有害生物。FIDO由MBARI工程师与美国地质调查局(USGS)以及快速eDNA评估与部署倡议和网络(READI-Net)合作开发。
MBARI SURF中心主任Jim Birch表示,MBARI正将工程创新应用于新型机器人DNA采样器的研发,设计重点包括经济性、可靠性与可扩展性,目标是用于识别威胁全国水道的病原体、寄生虫和入侵物种。
eDNA用于“无接触”识别水生生物
eDNA指生物在水生栖息地中留下的遗传物质,包括脱落细胞、皮肤、排泄物与黏液等形成的痕迹。研究人员可通过这些遗传线索,在未直接观察或采集生物体的情况下识别物种。相关描述称,即便是少量水样也可能包含细胞物质以及微小动物、藻类、病毒和游离DNA。

在应用层面,eDNA可用于评估与监测生物多样性,寻找稀有或濒危物种,并追踪入侵物种扩散情况。
从ESP到更轻便的FIDO
MBARI此前开发的环境样本处理器(ESP)最初面向海洋环境,可自主采集并处理样本,结合机器人技术与生物传感器进展,用于检测有害生物和毒素、评估水质,并采集与保存eDNA样本。ESP可将数据实时回传,为河流、湖泊与海洋栖息地健康状况提供近实时信息。MBARI表示,ESP体现了团队二十多年的工程积累。
不过,海洋应用对设备结构强度要求较高,使ESP重量达到181公斤(400磅),并可在水下50米(164英尺)深度运行。USGS研究人员在2017年关注其长期采样能力,尤其是eDNA采集能力。多次演示部署后,相关团队提出需要更小、更轻、功能更简化、可规模化生产且能在多样环境部署的仪器。
面向早期发现与快速响应的采样网络
USGS方面指出,入侵物种、病原体和寄生虫会造成生态与经济损害,威胁商业与休闲渔业,并增加疾病传播风险。USGS已将eDNA用于水生生物威胁的早期检测策略,以支持资源管理者和社区通过有效且经济的管理措施减轻影响。

READI-Net则开发了自主eDNA采样机器人、采样协议与分析工具,供管理者与科学家据此设计符合具体需求的早期检测项目。
MBARI与USGS于2022年11月启动合作,开发适用于河流与溪流健康监测及生物威胁检测的便携式机器人DNA采样器。MBARI工程师在过去三年中将ESP的核心组件改造为更小、更轻的设备。
相关团队表示,将eDNA与自主自动采样器结合,可实现全天候生物监测,减少对人员排班、人身安全或恶劣天气的依赖,并提升早期发现能力,从而支持管理者更快采取针对性措施。
设备参数与联网管理
MBARI介绍,FIDO可采集并保存多达144个样本,整机重量约22公斤(50磅),便于单人携带至现场。系统使用标准47毫米(1.8英寸)过滤器对环境水进行过滤,过滤器安装在可重复使用的滤芯中,采集材料将被保存以供后续分析。

在部署方式上,多台FIDO可通过单一云端网页界面进行控制,以便研究人员对设备网络进行集中监控。MBARI同时强调,FIDO在设计上也考虑相对低成本生产,以扩大可用人群范围。
培训与测试计划
MBARI称,去年12月工程师举办为期两天的培训研讨会,向USGS READI-Net项目成员及合作伙伴介绍FIDO使用方法,并在MBARI研究设施附近的莫斯登陆港部署两台设备。研讨会参与者还与MBARI工作人员共同编写了FIDO用户手册。
按计划,USGS READI-Net团队成员将在今年冬季对FIDO开展进一步实验室测试;夏季将启动多种环境的现场测试,场景包括USGS流量测站、研究船只和入侵物种通道。
MBARI表示,READI-Net等合作项目有助于推动工程创新在更广范围内应用。机构将通过优先考虑经济性与可扩展性,并发展合作伙伴关系,将相关技术转让给第三方进行商业生产,以扩大先进研究工具的使用范围。
