康奈尔团队工程化大肠杆菌监测砷暴露,验证低成本活体生物传感器思路

richlovec 1500_400 (1)
 

康奈尔大学研究人员开发出一种工程化大肠杆菌,用作监测环境中砷的生物传感器。研究团队表示,该工作为一种潜在低成本的活体传感器提供了原理验证:细菌可在厌氧条件下记录短暂的砷暴露,将信息保存在遗传物质中,并允许在实验室开放空气条件下进行延迟读取。

研究人员指出,在有氧与厌氧条件下同时实现砷暴露的检测与记录,一直是其他类型砷生物传感器面临的难点。团队同时提到,该传感器所采用的机制未来有望扩展至其他细菌种类,并用于检测其他毒素。

论文第一作者、康奈尔大学达菲尔德工程学院土木与环境工程系Andrea Giometto实验室博士生Elisa Garabello表示,团队构建的是一种“整体细胞生物传感器”,即利用活体细胞作为装置,在环境中生长时可指示目标物质是否存在。Giometto为该研究通讯作者,论文发表于《应用与环境微生物学》(Applied and Environmental Microbiology)。

研究背景显示,稻米通常种植于灌水稻田,这类环境为厌氧条件。稻米会从淹水土壤和水体中吸收天然存在的砷;在厌氧条件下,砷会转化为更易被生物体吸收的可移动形态。研究人员指出,食用受污染稻米可能使人类暴露于砷,砷具有致癌性,并可能导致儿童发育问题;砷在东南亚稻田中尤为常见。

在该研究中,团队对大肠杆菌进行工程化改造,使其携带Cre重组酶。当细菌接触砷时,该酶会触发遗传变化。研究人员称,这些变化发生在质粒(细菌的胞外染色体DNA)上的DNA中,即便目标污染物被移除,相关信号仍可在大肠杆菌中稳定检测长达12代,从而形成可追溯记录。此外,当细菌DNA发生重组时,荧光蛋白会发光,便于后续识别。

实验方面,研究团队借助共同作者、达菲尔德工程学院土木与环境工程系副教授Matthew Reid实验室的厌氧舱,在受控条件下将工程化大肠杆菌暴露于砷中两天。为测量反应,细菌样本随后在有氧条件下重新培养,并通过流式细胞仪快速检测单个细菌的荧光信号。

Giometto表示,团队可测量数十万个细胞,并识别出仅约100个发生重组的细胞,从而实现对极低纳摩尔级砷浓度的检测。

研究人员提到,利用酶改变DNA的生物传感器已在医疗领域有所开发,但在环境应用中相对少见。论文合著者还包括Reid实验室前博士生Hyun Yoon。


分享:


发表评论

登录后才可评论。 去登录