研究称土壤种子库或增加植物基因驱动控草难度

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基因驱动是一种基因工程方法,旨在将特定遗传改变快速传播到整个种群,可用于压制目标种群或引入新性状。尽管该技术被认为在杂草控制方面具备潜力,但相关研究此前主要集中在蚊子等动物上,尚未在现实世界中部署。

种子库被指为关键变量

一项最新建模研究对基因驱动在植物种群中的传播过程进行了模拟。研究结果显示,基因驱动能否顺利扩散,可能在很大程度上取决于“种子库”——埋藏在土壤中的种子储存层,这些种子可在数年甚至数十年后再度发芽。

研究指出,如果在设计与评估中未充分纳入种子库因素,土壤中储存的、未携带基因驱动的种子会在后续年份不断萌发并补充到种群中,从而减缓甚至阻碍基因驱动在植物中的传播。

研究由康奈尔大学安·S·鲍尔斯计算与信息科学学院及农业与生命科学学院(CALS)计算生物学助理教授金在熙(Jaehee Kim)与CALS计算生物学教授菲利普·梅塞尔(Philipp Messer)共同完成,论文题为《种子休眠塑造植物中基因驱动动态》,发表在《自然植物》(Nature Plants)。

CRISPR推动可行性,但野外风险仍受关注

研究团队提到,CRISPR-Cas9基因编辑技术的发展使得对基因组进行精确修改成为可能,从而提升了在实验室中构建基因驱动的可行性。不过,基因驱动可能扩散至非目标生物并在野外造成生态影响的担忧仍然存在。

梅塞尔表示,基因驱动概念已被讨论数十年,CRISPR的出现使其工程化更接近现实,但仍面临实验与建模层面的诸多问题,迄今尚无人真正释放基因驱动进入自然环境。

两种植物基因驱动系统进入模型评估

研究提到,近期研究人员在实验室中开发了两种植物基因驱动系统——CAIN和ClvR——可稳定遗传给后代,并使植物产生不活跃的花粉、胚珠或两者。

金在熙表示,在CAIN和ClvR出现之前,基因驱动在植物物种中的可行性尚未获得实验层面的证明。

为评估其在植物中的动态表现,研究团队建立了建模框架,模拟两种基因驱动随时间演变的过程。模型纳入了多项参数,包括单株植物产生的可育花粉或胚珠数量、种子在种子库中的存活时间,以及每年从种子库中发芽的种子数量。研究人员指出,种子库是理解植物基因驱动的重要因素,也是植物与其他已被研究的基因驱动物种之间的关键差异。

模拟结果:传播变慢与“天然缓冲”并存

模拟预测,CAIN和ClvR均可将工程突变传播至种群中。但研究同时发现,种子在土壤中存活时间越长,工程突变完成传播所需时间越长;此外,为压制后续从种子库萌发的储存种子,启动基因驱动可能需要投放更多工程种子或工程植株。

研究还指出,种子库虽然增加了传播难度,但也可能带来生物安全层面的益处:储存种子可能充当“进化缓冲器”,削弱基因驱动的扩散能力,使其不易在不适当地点持续传播。

金在熙称,即便基因驱动发生意外释放或外溢至不希望的种群,种子库也可能促使其随时间自然消退,从而在一定程度上形成天然的生物安全措施。

研究团队表示,希望该模型能为后续研究提供基础,帮助野外生物学家在部署前识别并缓解潜在问题,以实现更可控的基因驱动应用。梅塞尔则表示,建模结果改变了部分关于“植物基因驱动效果可能不佳”的看法,认为植物或许是更适合尝试基因驱动的系统之一。


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